Di kota bertembok Meridian, warga hidup di bawah Sistem Harmoni, sebuah jaringan saraf yang menghapus kenangan menyakitkan dan menyebarkan ketenangan ke setiap pikiran. Ivy, seorang arsiparis muda di Ruang Penyimpanan Memori Pusat, menghabiskan hari-harinya mengarsipkan fragmen-fragmen yang dihapus oleh sistem tersebut. Dia selalu percaya pada cerita resmi: melupakan adalah belas kasihan, dan ketertiban adalah perdamaian. Kemudian suatu malam dia menemukan sebuah ruang penyimpanan tersembunyi di mana kenangan tidak dihancurkan tetapi disimpan, dikatalogkan, dan dijual kepada penawar tertinggi. Di antara kenangan-kenangan itu, dia menemukan rekaman jam-jam terakhir ibunya sendiri, sebuah kematian yang oleh negara disebut sebagai kecelakaan.
Ivy bertemu Adrian, seorang insinyur sistem berambut merah tembaga yang senyumnya yang bengkok menyembunyikan rahasia berbahaya: dialah yang merancang brankas yang ditemukan Ivy. Dia diam-diam menyalin ingatan yang dicuri, menunggu seseorang yang cukup berani untuk membantunya mengungkap kebenaran. Bersama-sama mereka mulai membocorkan fragmen ke lingkaran bawah, tempat orang-orang mulai mengingat hal-hal yang seharusnya tidak pernah mereka rasakan. Setiap kebocoran membuat sistem melawan lebih keras, dan setiap perlawanan menarik Ivy dan Adrian semakin dekat.
Saat kota dilanda kerusuhan dan jam malam, Ivy mengungkap rahasia terdalam dari semuanya: Sistem Harmoni bukanlah mesin. Itu adalah pikiran hidup yang dibangun dari ingatan yang dikumpulkan, dan pikiran ibunya berada di intinya. Untuk membebaskan kota, Ivy harus memutuskan apakah akan menghancurkan sistem dan mengambil risiko kekacauan, atau menyelamatkan ibunya dan membiarkan kebohongan berlanjut. Loyalitas Adrian diuji ketika masa lalunya yang terhapus muncul kembali, mengungkapkan bahwa dia dan Ivy terikat oleh kejahatan yang tidak mereka ingat pernah lakukan.
Di babak terakhir, Ivy dan Adrian memimpin pemberontakan ke Menara Pusat, di mana kebenaran akhirnya diungkapkan kepada seluruh kota. Sistem runtuh, kenangan kembali membanjiri pikiran, dan Meridian harus belajar hidup dengan sukacita dan kesedihan. Ivy menjadi penjaga arsip baru, arsip yang tidak menyembunyikan apa pun, dan dia serta Adrian memulai kehidupan yang dibangun di atas kejujuran, bukan kendali. Kisah berakhir dengan harapan, tetapi juga dengan beban dari semua yang diingat.